Фауна

Фауна позвоночных животных заповедника насчитывает 269 видов. Большинство из них составляют птицы - 216 видов. Гнездится на территории заповедника 134 вида. Два тундровых вида - белая сова и кречет встречаются в зимнее время, 45 вида посещает территорию заповедника на весеннем и осеннем пролётах, а ещё 30 вида составляют группу залётных видов, попавших на нашу территорию случайно. На зиму большее число птиц улетает в тёплые края, а зимовать остаются только те, которые приспособились к суровым и бескормным зимам - таких насчитывается около 40 видов. В основном это мелкие воробьиные птицы, куриные (глухарь, рябчик, тетерев и куропатка), некоторые совы и дневные хищники.

Список млекопитающих на сегодняшний день насчитывает 40 видов. Больше половины из этого числа приходится на мелких млекопитающих - грызунов и бурозубок.

Из хищных зверей наиболее многочисленным по числу видов является семейство куньих - 8 видов. Соболь - самый обычный обитатель заповедной тайги - любит кормные пойменные леса. Колонок встречается реже.

В реках заповедника водятся американская норка и выдра. Из крупных куньих - росомаха и барсук, из мелких - горностай и ласка, причём последняя более обычна. Численность волка и лисы, как и всех хищников, зависит от количества жертв, поэтому не высока, но в общем они достаточно обычны, чего не скажешь о единственной нашей кошке - рыси. Это очень редкий зверь в заповеднике и на прилегающих территориях. Численность рыси сильно ограничивает высота снежного покрова и количество зайца-беляка. Медведь в заповеднике встречается повсюду, однако отдает некоторое предпочтение пойменным лесам, как наиболее кормным стациям.

Травоядные парнокопытные представлены лосем и северным оленем лесного подвида.

Самые таинственные обитатели заповедника - рукокрылые или летучие мыши. В заповеднике обнаружено 2 вида - северный кожанок и двухцветный кожан.

Из других позвоночных животных в заповеднике обитают: два вида пресмыкающихся - гадюка и живородящая ящерица, 4 вида земноводных - углозуб, обыкновенная жаба, остромордая и сибирская лягушки. В озёрах и реках заповедника обитает обычный набор пресноводной сибирской фауны: язь, щука, окунь, плотва, елец, ёрш, пескарь, серебряный и золотой караси.

В целом, по состоянию на конец 2012 года видовое разнообразие животных заповедника "Юганский" следующее:

беспозвоночные:
- водные беспозвоночные - 557 видов;
- пауки - 85 видов;
- стафилиниды - 169 видов;

позвоночные:
- амфибии - 4 вида;
- рептилии - 2 вида;
- птицы - 216 видов;
- млекопитающие - 40 видов.